Grupo de Héctor Candela
| Responsables | Héctor Candela Antón y Sara Jover Gil |
| @candela_lab |
RESUMEN DE LA INVESTIGACIÓN
El trabajo de nuestro grupo se centra en dos temas principales de investigación. Por un lado, estamos interesados en los genes que participan en la metilación N6 de los residuos de adenosina en el ARNm, utilizando la planta Arabidopsis thaliana como organismo modelo. Por otro lado, estamos interesados en desarrollar aplicaciones para el análisis de datos de secuenciación de nueva generación, en la interfaz entre la genética y la bioinformática.
LÍNEAS DE INVESTIGACIÓN
Línea 1: Análisis genético del mecanismo de la N6-metilación de los residuos de adenosina
La N6-metilación reversible de los residuos de adenosina es una de las muchas modificaciones post-transcripcionales que se conocen en las moléculas de ARN mensajero (ARNm). La N6-metiladenosina (m6A) se ha detectado en todos los eucariotas estudiados. A pesar de que esta modificación se conoce desde hace unas cuatro décadas, en los últimos años hemos asistido a un renovado interés por su estudio. Algunos avances recientes en este campo son la identificación del complejo multisubunidad metiltransferasa («escritor») responsable de la metilación de los residuos de adenosina, la identificación de enzimas con actividad desmetilasa («borrador») de m6A y la identificación del dominio YTH, presente en las proteínas que se unen a los ARNm que contienen m6A («lectores»). A pesar de estos avances, las funciones de la m6A a nivel celular y durante el desarrollo de la planta siguen siendo poco conocidas. Uno de nuestros objetivos es identificar las dianas y las interacciones proteína-proteína que son importantes para la regulación post-transcripcional de la expresión génica por parte de m6A.
Línea 2: Aplicación de herramientas bioinformáticas a la genética vegetal
Las tecnologías de secuenciación masiva en paralelo están permitiendo la secuenciación de numerosos genomas y transcriptomas a un precio asequible. Uno de nuestros objetivos en este ámbito se centra en el desarrollo de métodos mejorados para el ensamblaje de transcriptomas de plantas, en particular de algunas plantas cultivadas. Estamos utilizando las secuencias identificadas para desarrollar marcadores moleculares y otras herramientas para el estudio de algunas especies de cultivos de importancia agrícola.
R. Parreño, E. Rodríguez-Alcocer, C. Martínez-Guardiola, L. Carrasco, P. Castillo, V. Arbona, S. Jover-Gil, and H. Candela.
Turning Garlic into a Modern Crop: State of the Art and Perspectives.
Plants 12, 1212 (2023).
E. Rodríguez-Alcocer, E. Ruiz-Pérez, R. Parreño, C. Martínez-Guardiola, J.M. Berna, A. Çakmak Pehlivanlı, S. Jover-Gil, and H. Candela.
Cloning of an Albino Mutation of Arabidopsis thaliana Using Mapping-by-Sequencing.
International Journal of Molecular Sciences 24, 4196 (2023).
J.M. Acién, E. Cañizares, H. Candela, M. González-Guzmán, and V. Arbona
From Classical to Modern Computational Approaches to Identify Key Genetic Regulatory Components in Plant Biology.
International Journal of Molecular Sciences 24, 2526 (2023).
C. Navarro-Quiles, E. Mateo-Bonmatí, H. Candela, P. Robles, A. Martínez-Laborda, Y. Fernández, J. Šimura, K. Ljung, V. Rubio, M.R. Ponce, and J.L. Micol.
The Arabidopsis ATP-Binding Cassette E protein ABCE2 is a conserved component of the translation machinery.
Frontiers in Plant Science 13, 1009895 (2022).
P. Fresnillo, S. Jover-Gil, A. Samach, and H. Candela
Complete Genome Sequence of an Isolate of the Passiflora chlorosis virus from Passion Fruit (Passiflora edulis Sims).
Plants 11, 1838 (2022).
E. Fuster, H. Candela, J. Estévez, E. Vilanova, and M.A. Sogorb.
A Transcriptomic Analysis of T98G Human Glioblastoma Cells after Exposure to Cadmium-Selenium Quantum Dots Mainly Reveals Alterations in Neuroinflammation .
International Journal of Molecular Sciences 23, 2267 (2022).
C. De Ollas, M. González-Guzmán, Z. Pitarch, J.T. Matus, H. Candela, J.L. Rambla, A. Granell, A. Gómez-Cadenas, and V. Arbona
Identification of ABA-Mediated Genetic and Metabolic Responses to Soil Flooding in Tomato (Solanum lycopersicum L. Mill).
Frontiers in Plant Science 12, 613059 (2021).
E. Fuster, H. Candela, J. Estévez, E. Vilanova, and M.A. Sogorb
Titanium Dioxide, but Not Zinc Oxide, Nanoparticles Cause Severe Transcriptomic Alterations in T98G Human Glioblastoma Cells.
International Journal of Molecular Sciences 22, 2084 (2021).
S. Jover-Gil, A. Beeri, P. Fresnillo, A. Samach, and H. Candela
Complete genome sequence of a novel virus, classifiable within the Potyviridae family, which infects passion fruit (Passiflora edulis).
Archives of Virology 163, 3191-3194 (2018).
E. Rodríguez-Cazorla, S. Ortuño-Miquel, H. Candela, L.J. Bailey-Steinitz, M.F. Yanofsky, A. Martínez-Laborda, J.J. Ripoll, and A. Vera
Ovule identity mediated by pre-mRNA processing in Arabidopsis.
PLOS Genetics 14, e1007182 (2018).
Ayuda complementaria al proyecto “Una modificación postranscripcional casi desconocida: caracterización funcional de la metilación de adenosinas en el transcriptoma en Arabidopsis thaliana” (ACOMP/2015/042). Agencia de financiación: Ayudas para grupos de investigación de calidad contrastada. Modalidad B: Ayudas complementarias para proyectos de I+D. Conselleria de Educación (Generalitat Valenciana). Vigencia: 01/01/2015 – 31/12/2015.
PI: Héctor Candela
Una modificación postranscripcional casi desconocida: caracterización funcional de la metilación de adenosinas en el transcriptoma en Arabidopsis thaliana (BFU2012-31719). Agencia de financiación: Proyectos de Investigación Fundamental No Orientada (Plan Nacional I+D+i). Ministerio de Economía y Competitividad. Vigencia: 01/01/2013 – 31/12/2015.
PI: Héctor Candela
Ayuda a la preparación del proyecto IRIS: Integrating regulatory levels in plant developmental Switches (APE/2014/034). Agencia de financiación: Ayudas a grupos de investigación para la captación de proyectos europeos. Conselleria de Educación (Generalitat Valenciana). Vigencia: 01/01/2014 – 31/12/2014.
PI: Héctor Candela
Caracterización de mutantes afectados en la metilación N6 de adenosinas en Arabidopsis thaliana (INTERACTOm6A). Agencia de financiación: Ayudas 2021 para proyectos de investigación. Vicerrectorado de Investigación (Universidad Miguel Hernández de Elche). Vigencia: 01/01/2021 – 31/12/2021.
PI: Héctor Candela
Identificación de genes implicados en la respuesta a agentes teratógenos en C. elegans (GENEGANS). Agencia de financiación: Ayudas 2021 para proyectos de investigación. Vicerrectorado de Investigación (Universidad Miguel Hernández de Elche). Vigencia: 01/01/2021 – 31/12/2021.
PI: Sara Jover Gil